1. 目標(biāo)

通過hadoop hive或spark等數(shù)據(jù)計(jì)算框架完成數(shù)據(jù)清洗后的數(shù)據(jù)在HDFS上

爬蟲和機(jī)器學(xué)習(xí)在Python中容易實(shí)現(xiàn)

在Linux環(huán)境下編寫Python沒有pyCharm便利

需要建立Python與HDFS的讀寫通道

2. 實(shí)現(xiàn)

安裝Python模塊pyhdfs

版本:Python3.6, hadoop 2.9

讀文件代碼如下

from pyhdfs import HdfsClientclient=HdfsClient(hosts=’ghym:50070’)#hdfs地址res=client.open(’/sy.txt’)#hdfs文件路徑,根目錄/for r in res: line=str(r,encoding=’utf8’)#open后是二進(jìn)制,str()轉(zhuǎn)換為字符串并轉(zhuǎn)碼 print(line)

寫文件代碼如下

from pyhdfs import HdfsClientclient=HdfsClient(hosts=’ghym:50070’,user_name=’hadoop’)#只有hadoop用戶擁有寫權(quán)限str=’hello world’client.create(’/py.txt’,str)#創(chuàng)建新文件并寫入字符串

上傳本地文件到HDFS

from pyhdfs import HdfsClientclient = HdfsClient(hosts=’ghym:50070’, user_name=’hadoop’)client.copy_from_local(’d:/pydemo.txt’, ’/pydemo’)#本地文件絕對路徑,HDFS目錄必須不存在

3. 讀取文本文件寫入csv

Python安裝pandas模塊

確認(rèn)文本文件的分隔符

# pyhdfs讀取文本文件,分隔符為逗號,from pyhdfs import HdfsClientclient = HdfsClient(hosts=’ghym:50070’, user_name=’hadoop’)inputfile=client.open(’/int.txt’)# pandas調(diào)用讀取方法read_tableimport pandas as pddf=pd.read_table(inputfile,encoding=’gbk’,sep=’,’)#參數(shù)為源文件,編碼,分隔符# 數(shù)據(jù)集to_csv方法轉(zhuǎn)換為csvdf.to_csv(’demo.csv’,encoding=’gbk’,index=None)#參數(shù)為目標(biāo)文件,編碼,是否要索引

補(bǔ)充知識：記 讀取hdfs 轉(zhuǎn) pandas 再經(jīng)由pandas轉(zhuǎn)為csv的一個(gè)坑

工作流程是這樣的：

讀取 hdfs 的 csv 文件，采用的是 hdfs 客戶端提供的 read 方法，該方法返回一個(gè)生成器。

將讀取到的數(shù)據(jù)按 逗號 處理，變?yōu)橐粋€(gè)二維數(shù)組。

將二維數(shù)組傳給 pandas，生成 df。

經(jīng)若干處理后，將 df 轉(zhuǎn)為 csv 文件并寫入hdfs。

問題是這樣的：

正常的數(shù)據(jù)：

ZERO,MEAN,STD,CV,INC,OPP,CS,IS_OUTNET

0,9.233,2.445,0.265,1.202,241,1,0

0,8.667,1.882,0.217,1.049,179,1,0

三行數(shù)據(jù)，正常走流程，沒有任何問題。

異常數(shù)據(jù)：

ZERO,MEAN,STD,CV,INC,OPP,CS,IS_OUTNET,probability,prediction

0,9.233,2.445,0.265,1.202,241,1,0,’[0.9653901649086855,0.03460983509131456]’,0.0

0,8.667,1.882,0.217,1.049,179,1,0,’[0.9653901649086855,0.03460983509131456]’,0.0

在每一行中都會(huì)有一個(gè)數(shù)組類似的數(shù)據(jù)，有一對引號包起來，中間存在逗號，不可以拆分。

為此，我的做法如下：

匹配逗號是被成對引號包圍的字符串。

將匹配到的字符串中的逗號替換為特定字符。

將替換后的新字符串替換回原字符串。

在將原字符串中的特定字符串替換為逗號。

本來這樣做沒有什么問題，但是在經(jīng)由pandas轉(zhuǎn)為csv的時(shí)候，發(fā)現(xiàn)原來帶引號的字符串變?yōu)榱饲昂蟾鲙齻€(gè)引號。

源數(shù)據(jù)：

處理后的數(shù)據(jù)：

方法如下：

仔細(xì)研究對比了下數(shù)據(jù)，發(fā)現(xiàn)數(shù)據(jù)里的引號其實(shí)只是在純文本文件中用來標(biāo)識其為字符串，并不應(yīng)該存在于實(shí)際數(shù)據(jù)中。

而我每次匹配后都是原封不動(dòng)替換回去，譬如：

源數(shù)據(jù)：

'[0.9653901649086855,0.03460983509131456]'

匹配替換后：

'[0.9653901649086855${dot}0.03460983509131456]'

這樣傳給pandas，它就會(huì)認(rèn)為這個(gè)數(shù)據(jù)是帶引號的，在重新轉(zhuǎn)為csv的時(shí)候，就會(huì)進(jìn)行轉(zhuǎn)義等操作，導(dǎo)致多出很多引號。

所以解決辦法就是在替換之前，將匹配時(shí)遇到的引號也去掉：

PATTERN = ’(?<=(?P<quote>[’']))([^,]+,[^,]+)+?(?=(?P=quote))’

中間 ([^,]+,[^,]+)+? 要用+？，因?yàn)楸仨毚_定是有這樣的組合才可以，并且非貪婪模式，故不可 ？ 或者 *？

（ps：為了方便后面引用前面的匹配，我在環(huán)視匹配中創(chuàng)建了一個(gè)組）

再來個(gè)整體效果：

為了說明效果，引用pandas的自帶讀取csv方法：

可以看到pandas讀取出的該位置數(shù)據(jù)也是字符串，引號正是作為一個(gè)字符串聲明而存在。

再次修改正則：

def split_by_dot_escape_quote(string): ''' 按逗號分隔字符串，若其中有引號，將引號內(nèi)容視為整體 ''' # 匹配引號中的內(nèi)容，非貪婪，采用正向肯定環(huán)視， # 當(dāng)左引號（無論單雙引）被匹配到，放入組quote， # 中間的內(nèi)容任意，但是要用+？，非貪婪，且至少有一次匹配到字符， # 若*？，則匹配0次也可，并不會(huì)匹配任意字符（環(huán)視只匹配位置不匹配字符）， # 由于在任意字符后面又限定了前面匹配到的quote，故只會(huì)匹配到'， # +？則會(huì)限定前面必有字符被匹配，故''，或引號中任意值都可匹配到 pattern = re.compile(’(?=(?P<quote>[’'])).+?(?P=quote)’) rs = re.finditer(pattern, string) for data in rs: # 匹配到的字符串 old_str = data.group() # 將匹配到的字符串中的逗號替換為特定字符， # 以便還原到原字符串進(jìn)行替換 new_str = old_str.replace(’,’, ’${dot}’) # 由于匹配到的引號僅為字符串申明，并不具有實(shí)際意義， # 需要把匹配時(shí)遇到的引號都去掉，只替換掉當(dāng)前匹配組的引號 new_str = re.sub(data.group(’quote’), ’’, new_str) string = string.replace(old_str, new_str) sps = string.split(’,’) return map(lambda x: x.replace(’${dot}’, ’,’), sps) s = ’'2011,603','3510006998','F','5','5','0',''’print(list(split_by_dot_escape_quote(s)))

運(yùn)行結(jié)果如下：

之前想的正則有些復(fù)雜，反而偏離了本意，還是對正則的認(rèn)識不夠深。

以上這篇Python連接HDFS實(shí)現(xiàn)文件上傳下載及Pandas轉(zhuǎn)換文本文件到CSV操作就是小編分享給大家的全部內(nèi)容了，希望能給大家一個(gè)參考，也希望大家多多支持好吧啦網(wǎng)。